DEPARTAMENTO MICROBIOLOGÍA

    • Jefe Departamento: Dra. Silvia Carla Predari
    • Ubicación: Segundo Cuerpo, Planta baja
    • Teléfono: 5287-3913 - Interno: 73913
    • Email: microbiologia@lanari.fmed.uba.ar

Presentación
En el Departamento de Microbiología del Instituto de Investigaciones Médicas Alfredo Lanari - UBA, se realizan actividades asistenciales, docentes y de investigación clínica. El servicio funciona en dos turnos, de lunes a viernes desde las 7,00 hs. hasta las 20,30 hs. y los sábados de 8 a 13 hs.
Con respecto a la actividad asistencial se realiza el diagnóstico etiológico de los procesos infecciosos de los pacientes que acuden a la institución; es decir, de los internados en las salas de Clínica Médica, Cuidados Intensivos, de los pacientes quirúrgicos, de los pacientes con insuficiencia renal aguda y crónica terminal en hemodiálisis o en diálisis peritoneal, de los pacientes en plan de trasplante renal y los trasplantados y de los pacientes ambulatorios que se atienden en los consultorios externos.

También se realizan estudios de pacientes pertenecientes a distintas obras sociales y sistemas de medicina prepaga.
Con respecto a la actividad docente se imparte a los residentes (bioquímicos y médicos), concurrentes y pasantes. Se dictan cursos/clases de la especialidad dentro y fuera del Instituto.
Con respecto a la investigación clínica, en el servicio se siguen las siguientes líneas de trabajo:
1. Taxonomía e infecciones asociadas a los estafilococos coagulasa negativos y coagulasa positivos
2. Infección e infertilidad masculina
3. Infecciones en los pacientes con insuficiencia renal crónica terminal en hemodiálisis y diálisis peritoneal
4. Bacterias anaerobias: infecciones asociadas, taxonomía y mecanismos involucrados en las variaciones de los perfiles de sensibilidad

Plantel

  • Jefe Departamento: Dra. Silvia Carla Predari
    • Bioquímica - UBA. Especialista en Bioquímica Clínica, Área Bacteriología Clínica (UBA).
    • Especialista en Microbiología Clínica (Asociación Argentina de Microbiología).
    • Directora de la Revista Argentina de Microbiología, publicación científica oficial de la Asociación Argentina de Microbiología.
    • Presidente del Comité de Docencia e Investigación del Instituto de Investigaciones Médicas A. Lanari - UBA.
    • Coordinadora del Comité de Emergencias Biológicas de la Red de Hospitales e Institutos de la Universidad de Buenos Aires.
    • Miembro del Comité Académico y Docente Invitada de la Carrera de Especialización en Bioquímica Clínica, Área Bacteriología Clínica, de la Facultad de Farmacia y Bioquímica. UBA.
    • Miembro de la Subcomisión de Bacterias Anaerobias de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC) - Asociación Argentina de Microbiología.
    • Miembro del Comité de Infecciones del Instituto de investigaciones Médicas A. Lanari - UBA.
    • Miembro de la American Society for Microbiology y de la Anaerobe Society of the Americas.
    • Editora en Jefe del MANUAL DE MICROBIOLOGÍA CLÍNICA, publicación de la Asociación Argentina de Microbiología. En edición.
  • Jefe División Bacteriología: Dra. Adriana Noemí De Paulis
    • Bioquímica - UBA. Especialista en Microbiología Clínica (Asociación Argentina de Microbiología).
    • Miembro del Comité de Ética del Instituto de Investigaciones Médicas A.  Lanari - UBA.
    • Vice-Presidente de la Asociación de Profesionales del Instituto de Investigaciones Médicas A. Lanari (APIIM) - UBA.
  • Dr. Miguel Ángel Gutiérrez: Antimicrobianos y Monitoreo de Drogas
    • Bioquímico - UBA.
    • Coordinador de la Unidad Ejecutora de Relevamientos de Activos (UERA) del Instituto de Investigaciones Médicas A. Lanari - UBA. 
  • Dra. Liliana Castello: Bacterias Anaerobias y Microorganismos relacionados
    • Bioquímica - UBA. Especialista en Microbiología Clínica (Asociación Argentina de Microbiología).
    • Miembro de la Subcomisión de Bacterias Anaerobias de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC) - Asociación Argentina de Microbiología.
  • Dra. Eugenia Bertona: Bacterias Aerobias y Facultativas
    • Bioquímica - Universidad Nacional de Córdoba.
    • Especialista en Bioquímica Clínica, Área Bacteriología Clínica (UBA) 
  • Lic. Viviana Stuchi
    • Técnica de Laboratorio en Análisis Clínicos.
    • Licenciada en Ciencias Biológicas - Fac. de Ciencias Exactas y Naturales - UBA.
  • Graciela Vázquez
    • Técnica de Laboratorio en Análisis Clínicos.
    • Técnica en Hemoterapia e Inmunohematología. 
  • Residentes que realizan la rotación programada por Microbiología: dos por año por un período de seis meses cada uno y el año electivo (4º año de la residencia) cuando el servicio es elegido por el residente.
    • Bioq. Daiana Guevara Núñez (Jefe de Residencia Bioquímica 2014).
    • Bioq. Luciana Gualco.
  • Pasantes que realizan su tesis de grado en Microbiología
    • Srita. Ayelén Rapoport, estudiante de Biotecnología en la Universidad de Morón.

Información para Pacientes

Información útil para los pacientes ambulatorios
Plazo habitual de entrega de los resultados: el intervalo en el plazo de entrega de los resultados oscila entre 24 hs. y 2 meses, dependiendo de la naturaleza del material en estudio y el tipo de examen a realizar.
Ej.: 1. Urocultivo sin reacción inflamatoria, cuya coloración de Gram es negativa y el cultivo también es negativo se informa a las 24 hs.

    • Todos aquellos materiales que requieren Cultivo para Koch se mantienen en estudio hasta 2 meses.
    • Todos aquellos materiales que requieren examen micológico se mantienen en estudio hasta 2 meses.
    • Los hemocultivos y los líquidos de punción se mantienen en estudio hasta 14 días.
    • El resto de los materiales se informa entre los 2 y 7 días.

Valores de referencia de las prácticas:
Todos aquellos materiales NOBLES, es decir que son naturalmente estériles, si el proceso infeccioso está ausente son negativos.
Todos aquellos materiales que provienen de mucosas con flora normal, si el proceso infeccioso está ausente, simplemente se aísla esa flora normal.
Material sobre el cual se realiza la determinación:
Definido por la naturaleza del mismo. Ej: urocultivo sobre orina; coprocultivo sobre materia fecal, hemocultivo sobre sangre entera; esputo sobre expectoración significativa; etc.

Prestaciones
El examen microbiológico de los materiales que se detallan a continuación incluye: el estudio bacteriológico, micobacteriológico y micológico.
Se realizan exámenes en fresco, coloraciones, improntas para inmunofluorescencia directa (IFD), junto con los cultivos en los medios adecuados para la búsqueda de las múltiples bacterias aerobias, anaerobias facultativas, anaerobias estrictas, micobacterias, hongos y levaduras, micoplasmas y clamidias.
Se realiza la identificación bioquímica con la búsqueda de los antígenos de los agentes etiológicos aislados y de las toxinas, cuando corresponde, y las pruebas de sensibilidad a los distintos antibióticos por los métodos cualitativos y/o cuantitativos. También se realiza el monitoreo de la terapia antimicrobiana, cuando corresponde.
Materiales del tracto respiratorio superior

    • Exudado de fauces
    • Material nasofaríngeo
    • Hisopado nasal
    • Punción de senos paranasales
    • Secreciones de oído externo y medio

Materiales del tracto respiratorio inferior

    • Esputo (obtenido por expectoración espontánea o inducido)
    • Lavado gástrico (para Mycobacterium tuberculosis)
    • Aspirado endotraqueal
    • Lavado bronquial
    • Lavado broncoalveolar (BAL)
    • Cepillado pulmonar (a través del cepillo envainado)
    • Biopsia transbronquial
    • Biopsia pulmonar (a cielo abierto)
    • Punción aspiración pulmonar
    • Líquido pleural
    • Biopsia pleural

Materiales del tracto gastrointestinal

    • Bilicultivo
    • Coprocultivo
    • Líquido ascítico / peritoneal
    • Biopsia intestinal

Materiales del tracto genitourinario

    • Urocultivo (orina obtenida por: micción espontánea, punción de sonda vesical, punción suprapúbica)
    • Exudado uretral
    • Flujo vaginal
    • Exudado endocervical
    • Material intrauterino
    • Cálculos (renales, prostáticos, etc.)

Otros materiales

    • Hemocultivo seriado automatizado
    • Retrocultivo
    • Punta de catéter
    • Médulocultivo
    • Líquido cefalorraquídeo
    • Otros líquidos de punción: articular, pericárdico, etc.
    • Biopsias
    • Abscesos
    • Heridas superficiales y profundas
    • Secreción conjuntival

Estudios Especiales

  • Estudio microbiológico de la vía seminal:
    • PROSTATITIS CRÓNICA: incluye los siguientes materiales:
      • Hisopado uretral
      • Orina, primera porción de la micción (5 - 10ml)
      • Orina, chorro medio
      • Líquido prostático
      • Orina post masaje prostático (3 - 5 ml)
    • Infertilidad masculina y/o infección en glándulas
      • ANEXAS : incluye los siguientes materiales:
      • Hisopado uretral
      • Orina, primera porción de la micción (5 - 10 ml)
      • Orina, chorro medio
      • Líquido prostático
      • Orina pos masaje prostático (3 - 5 ml)
      • Semen
  • Estudios de vigilancia: incluyen la investigación microbiológica de los microorganismos de patogenicidad reconocida y/o potencialmente patógenos en las diferentes mucosas (ej. hisopados: de fauces, nasal, rectal, axilar, de pericatéter, cuando corresponda).
  • Estudios de portación: orientados hacia la búsqueda de:

Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae (en las embarazadas), Listeria monocytogenes, (en las pacientes con abortos a repetición), Staphylococcus aureus resistente a la meticilina,  enterococos resistentes a la vancomicina, enterobacterias portadoras de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE), microorganismos portadores de carbapenemasas (metalo-beta-carbapenemasas y serin-carbapenemasas) y de cualquier otra disbacteriosis/ micosis (en los pacientes neutropénicos).

  • Estudio de las peritonitis infecciosas en los pacientes en diálisis peritoneal [continua ambulatoria (DPCA) y automatizada (DPA)]:
    • Líquidos de DPCA y DPA
    • Secreción pericatéter
  • Control microbiológico de los sistemas de aguas de hemodiálisis:
    • agua de red
    • agua pre-ósmosis reversa
    • agua pos-ósmosis reversa
    • agua de los últimos puestos de diálisis de todas las salas
    • agua de las salas de lavado de los filtros
  • Monitoreo de la terapia antibiótica: incluye las determinaciones de :
    • Concentraciones inhibitoria y bactericida mínimas (CIM - CBM)
    • Poderes inhibitorio y bactericida del suero (PIS - PBS)
    • Combinación de antibióticos (para la determinación de sinergia, sinergia bactericida, aditividad, indiferencia y antagonismo). Método: cinético o de las curvas de letalidad en función del tiempo.

Determinaciones Especiales

  • Examen micológico: para micosis superficiales, oportunistas y profundas.
  • Cultivo para Koch: incluye baciloscopía o coloración de Ziehl Neelsen y cultivo en los medios de Lowestein Jensen, Stonebrink y en los frascos Myco F Lytic  del sistema automatizado de hemocultivos BACTEC 1290 (BD-Argentina).
  • Investigación de bacterias anaerobias:
    • cultivo
    • identificación bioquímica hasta el nivel de especie, subespecie o biovariedad
    • pruebas de sensibilidad (métodos: de elución y de dilución en medio sólido)
  • Investigación de micoplasmatales (Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis, etc.):
    • cultivo
    • identificación bioquímica
  • Investigación de Chlamydia trachomatis: por IFD.
  • Investigación de Pneumocystis jirovecii: por coloración de Azul de Orto - Toluidina modificada y Giemsa.
  • Investigación de Cryptosporidium spp. e Isospora belli: por coloración de Ziehl Neelsen modificada.
  • Identificación de antígenos bacterianos y micóticos en diferentes materiales biológicos (ej.: de Streptococcus pneumoniae en orina, de Cryptococcus neoformans en LCR, etc.)
  • Investigación de toxinas (A+B) de Clostridium difficile por inmunocromatografía y cultivo de Clostridium difficile.
  • Investigación de Helicobacter pylori: en las biopsias (cuerpo y antro) obtenidas vía endoscópica de los pacientes con gastritis y/o úlceras gástricas. Se realiza cultivo, identificación bioquímica y pruebas de sensibilidad cuantitativas.

Otras determinaciones

  • Coloraciones: Gram, Ziehl Neelsen, Giemsa, Kinyoun, etc.
  • Exámenes en fresco y Tinta China.
  • Antibiograma cualitativo: método de difusión en placa con monodiscos (a elección  
  • según el agente etiológico aislado y el sitio de la infección).
  • Detección de beta - lactamasas: método de Nitrocefín (cefalosporina cromogénica).
  • Conteos de colonias: en orinas, catéteres, retrocultivos, hemocultivos, etc.

Controles de Calidad Externos

El Departamento de Microbiología participa en los Programas Nacionales de Control de Calidad en BACTERIOLOGÍA y en MICOLOGÍA del Ministerio de Salud, Secretaría de Políticas de Regulación Sanitaria, INEI-ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”.

INSTRUCCIONES PARA LA PREPARACIÓN  DEL PACIENTE
E S P U T O: recolección  de  la  muestra

En la mañana al levantarse realizar:

  • Cepillado de dientes
  • Enjuagues bucales con:
  • Solución de bicarbonato de sodio (1 cucharadita en medio vaso de agua), o
  • Solución de agua oxigenada  (1 cucharada de 10 volúmenes en medio vaso de agua)
  • Recolectar la primera expectoración de la mañana en frasco estéril de boca ancha, para ello:
    • Toser con fuerza 2 ó 3 veces y expectorar directamente dentro del frasco, evitando se agregue saliva; colocar sólo una expectoración en el frasco
    • Si la expectoración fuera escasa, INDUCIR el esputo mediante:
      • Fisioterapia torácica
      • Drenaje postural
      • Nebulizaciones con solución fisiológica (3 a 4 por día, 1 ó             

     2 días previos a la recolección de la muestra)

  • Traer el esputo al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto con la “Solicitud de pedido” completada  por el médico y autorizada por la Obra Social.

5.  Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 24 hs. Lo  ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

Cultivo para Koch y otras micobacterias:

  1. Se debe realizar un seriado de 3 días consecutivos, respetando las indicaciones descriptas en la recolección para cada uno de los esputos.
  2. Remitir las muestras al Instituto cada día. Si Ud. vive muy lejos, luego de extraído cada esputo colocarlo en heladera (no congelar), y traer los 3 frascos en la mañana del tercer día.

SI  UD.  CUMPLE  ESTRICTAMENTE CON ESTAS INDICACIONES
EL  UNICO  BENEFICIADO  SERA  UD.
O R I N A
(para Urocultivo): recolección de la  muestra

  1. Recolectar la primera orina de la mañana o con más de 3 hs. de retención.
  2. Para ambos sexos, pacientes adultos: realizar higiene cuidadosa de genitales externos con agua y un jabón nuevo.

SEXO MASCULINO: realizar la  higiene  con   el  prepucio  retraído.

  1. Enjuague con  abundante agua.
  2. Secado  con  gasa  estéril  o  con  una  toalla  perfectamente  limpia.
  3. SEXO  FEMENINO: la mujer adulta debe separar labios y hacer  TAPONAMIENTO  VAGINAL  con una torunda de algodón envuelta en gasa, o con un tampón vaginal comercial (tipo los OB).
  • Emitir  la  orina  en  un  frasco  estéril  de boca  ancha, descartar la     

     primera porción de la micción  y recolectar  el  chorro  medio (unos    
30 a 40 ml).

    • Traer la orina al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto  con  la “Solicitud  de  pedido”  completada  por  el médico y autorizada por la Obra Social.
  • Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción y dentro de las 3 hs. de recolectada, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 24 hs. Lo  ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección. Si tarda más de 3 hs. en llegar al Instituto, tráigala refrigerada. (Ponga el frasco perfectamente cerrado y derecho que no se vuelque, en una caja de telgopor o plástica con hielo o con un refrigerante). 

Cultivo para Koch:

  • Se debe realizar un seriado de 3 días consecutivos, respetando las indicaciones descriptas  en  la  recolección  para cada  una  de las orinas.
  • Remitir las muestras al Instituto  cada día. Si Ud. vive muy lejos, luego de extraída cada orina colocarla en heladera (no congelar), y traer los 3 frascos en la mañana del tercer día.

SI  UD.  CUMPLE  ESTRICTAMENTE CON ESTAS INDICACIONES
EL  UNICO  BENEFICIADO  SERA  UD.

MATERIA  FECAL (para Coprocultivo): recolección de la  muestra

Este estudio se realiza en los pacientes con  DIARREA (que tengan por lo menos  3  deposiciones  diarias  de  heces  diarreicas, en  los  últimos 2  días).
La materia fecal formada, NO debe ser recolectada.

  • Evacuar en una chata o similar (previamente, perfectamente higienizada con agua y jabón), teniendo la  precaución de no orinar simultáneamente.
  • Colocar aproximadamente una cucharada de las porciones más mucopurulentas, mucosas o sanguinolentas en el frasco estéril con un medio de transporte que provee el Departamento de Microbiología del Instituto. Utilizar una cuchara de plástico descartable.
    • Traer la muestra al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10  hs.  junto  con  la  “Solicitud  de  pedido”  completada  por  el  médico  y autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 24 hs.
Lo  ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

BÚSQUEDA  DE  TOXINAS  DE  Clostridium  difficile  (A + B)  en  pacientes con diarrea asociada a antibióticos o quimioterápicos
 
Este estudio se realiza en los pacientes con DIARREA (que tengan por lo menos 3 deposiciones diarias de heces diarreicas, en los últimos 2 días) y que hayan recibido antibióticos o quimioterápicos en los 2 meses previos a la aparición de la diarrea.  La materia fecal formada, NO debe ser recolectada.

      • Evacuar en una chata o similar (previamente, perfectamente higienizada con agua y jabón), teniendo la  precaución de no orinar simultáneamente.
      • Colocar aproximadamente una cucharada de las porciones más mucopurulentas, mucosas o sanguinolentas (10-20 ml, mínimo 5 ml ó 5 gramos) en un frasco SIN conservantes (ej. frasco para urocultivo con tapa a rosca). Utilizar una cuchara de plástico descartable.
      • Traer la muestra al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10  hs.  junto  con  la  “Solicitud  de  pedido”  completada  por  el  médico  y  autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 48 hs.
Lo  ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

En cada caso y sin excepción, cada muestra se acompañará de la  SOLICITUD  DE  PEDIDO  (del Departamento de Microbiología del Instituto), donde se deberán consignar los siguientes datos:

  • Paciente: apellido y nombre
  • Edad                      
  • Nº de Historia Clínica (si la tiene)
  • Enfermedad de base
  • Tratamiento antibiótico:  cuál y por cuánto tiempo
  • Idem para los quimioterápicos
  • Si estuvo internado: cantidad de días
  • Fecha de recolección de la muestra
  • Firma del médico solicitante

 

RECOLECCIÓN DE MUESTRAS PARA EXAMEN MICOLÓGICO

INSTRUCCIONES PARA LA PREPARACIÓN  DEL PACIENTE
REQUISITOS PREVIOS

  • Suspender 1 mes antes la toma de  antimicóticos.
  • No recortar las uñas afectadas en la semana previa a la toma de muestra.
  • No colocarse cremas, soluciones o aerosoles antimicóticos.
  • No aplicar esmalte de uñas ni colocarse cremas humectantes, talcos, antisépticos dentro de los tres días previos a la toma de la muestra.

Uñas

  • Cepillar las uñas afectadas con agua y jabón blanco neutro 3 veces por día durante 3 días consecutivos.
  • Previo a la toma de muestra, sumergir en agua con sal durante 10 minutos (1 cuchara sopera de sal fina en 1 litro de agua hervida y entibiada). 
  • Secar y colocar medias de algodón en el caso de las uñas de los pies para concurrir al Laboratorio.

Piel y cuero cabelludo

  • Higienizarse con agua y jabón blanco neutro.
  • Enjuagarse con abundante agua antes de concurrir al Laboratorio.

 

Ultima modificación: 10/11/2016

Video Institucional

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Eventos

  • Jornadas Científicas

    Jornadas Científicas

    Se realizaran en Noviembre 2018

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Como llegar

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